知识产权代理公司注册流程如下：
1、名称预核准
提出设立申请前，先向国家知识产权局提出名称预核准申请，其中可包含一个或多个有意向的机构名称，由国家知识产权局核准可用的机构名称。
2、提交设立申请
向代理机构所在地的省、自治区、直辖市知识产权局提出设立申请，并提交下列文件：
(1)设立专利代理机构申请表一份;
(2)合伙协议书或章程原件一份;
(3)验资证明(合伙制专利代理机构提交银行存款单据复印件，有限责任制专利代理机构提交会计师事务所出具的验资报告原件)一份;
(4)专利代理人登记表每人一份;
(5)专利代理人资格证、身份证复印件每人各一份等。
3、审批及备案经所在地知识产权局审查合格，国家知识产权局批准后发放专利代理机构注册证正、副本。专利代理机构获得专利代理机构注册证正、副本后需尽快到工商、税务等部门办理相关手续，并及时向国家知识产权局提交下列材料进行备案。